雖然朱由校有計劃郡縣朝鮮，納入大明版圖，但計劃外的事情也有不少，未來能否實現這個願望還很難說，畢竟朝鮮擁有著一千多萬人口，而且獨立存在了上千年，有著他們獨特的文化與民族觀念，想短期內兼並與消化朝鮮，並不是一件容易的事情。
現在既然能夠割讓永宗島，不出意外的話，意味著它已經成為了大明的新國土，對於這點，朱由校自然沒有什麼不滿，反而欣賞熊文燦能夠靈活決斷，為大明爭取更好的利益。
對於功臣，朱由校自然不會吝嗇，除了賞賜一些金銀布匹，還給熊文燦升了官位，由原來的的正五品祠祭司郎中升到了正四品的太常寺少卿兼提督四夷館。
至於袁崇煥，一個三甲進士在寸功未立的情況下，為官未滿兩年，就升到了正六品的主事，已經足夠恩賞了，所以朱由校隻是多賞了一點財物。
既然朝鮮多了一塊大明的國土，而且逼迫朝鮮對大明開放了通商口岸，自然需要官員前去治理。
剛開始方從哲提議在三個島上各設立一個巡檢司，但遭到了徐光啟與李長庚等人的反對，他們認為設立巡檢司太不重視這些地方了。
李長庚建議設立永宗縣，但卻遭到了吏部尚書方從哲的極力反對，一個幾千人的小島設立一個縣，那是極度浪費寶貴的官職，而且也無法管理相距遙遠的濟州島與影島。
徐光啟提議設立類似市舶司的提舉，負責商貿往來之事，同時監管下永宗島與影島上的百姓，至於大明在這些地方的駐軍，自然由兵部管理。
至於麵積較大濟州島，徐光啟建議設立一個縣，正式納入大明的管理中來。
至於禮部尚書魏廣微，則是以三島遠離大明本土，建議設立衛所，再在永宗島設立一個處理商貿往來的大使即可。
在聽完幾人的建議後，朱由校最終放棄了原先設立總督的想法，經過一番權衡後，最終決定在永宗島設立大明駐朝大使，從五品官職，直屬於禮部管轄，主要負責與朝鮮的商貿往來之事，同時監管三島民政與幾個通商口岸的糾紛問題。
除此之外，在濟州島設立濟州縣，歸屬駐朝大使管轄。
至於大使與濟州知縣的人選，朱由校沒有讓他們當場舉薦，而是讓吏部遴選，最終由他批準。
朱由校這樣做，並不是為了所謂的遵循舊有慣例，而是想繼續看看朝中哪些人屬於什麼黨派。
自從連續打擊了東林黨之後，朱由校越來越分不清哪些人到底屬於哪些黨派了，廠衛雖然能幫他調查一些官員底細，但自從文官們再次深刻體會了廠衛的無孔不入後，他們就再也不敢明目張膽地集會或上門拜訪了，多是采用第三方地點由他人轉述或書信往來，這給廠衛的監視帶來了極大的困難。
商議完民政與商貿之事，朱由校得認真思考思考該如何布局這三個島的軍事布防問題，對於徐光啟建議的交由兵部管理，朱由校自然是不讚同的，在沒有完成軍事改革前，他是不會將重要地區或新增領土交給兵部管理的。
未來朝鮮肯定是要納入大明版圖中來的，至於是慢慢同化還是軍事快速占領，這個朱由校還沒有來得及認真考量。
畢竟大明現在烽煙四起，而且還要完成國內的軍事改革，實在是抽不出太多兵力去占領朝鮮。
朝鮮軍隊戰力或許很弱，但人家好歹有著一千多萬人口，攻打容易占領卻難。
而且朝鮮地少人多，資源匱乏，短期內幾乎不能為大明帶來什麼效益，反而要付出極大的代價，現在這種與他們開展商貿的方式，大明肯定是處於長期入超的地位。
雖然暫時不派重兵攻打朝鮮，但現有的三個島嶼也不能不派兵駐紮，不管是保護商隊也好，還是為下一步攻打朝鮮與日本做準備也好，都得派一支不弱的軍隊駐紮這些地方，尤其是濟州島。
濟州島麵積隻是略小於後世的深圳，屬於典型火山噴發形成的中間高四周低的島嶼，位於大明、朝鮮、日本三者之間，地理位置十分重要，是非常理想的海軍基地。
既然不能交給兵部，也就是交給渤海水師管理，那隻能交給都督府管理了，至於五軍都督府這個養老部門，朱由校連考慮都沒有考慮。
至於渤海水師，在近海搞搞運輸、打打海盜還行，遠洋作戰就不夠看了。
都督府現在有兩支海軍，一支是沈壽嶽統領的海軍第一營，另一支則是王興統領的海軍第二營，一南一北互不統屬，這也是未來朱由校南北海軍的種子。
濟州島雖然離長江出海口更近，但朱由校還是想將此處交給海軍第一營，因為長江以北被朱由校認為是屬於北方海軍。
既然濟州島劃撥給北方海軍，但目前北方隻有一支都督府直管的海軍，也就是海軍第一營，現在第一營駐地在大沽口。
防區主要是渤海，負責京城東麵的海上安全，肯定無法全部離開，短時間內派遣一兩個千戶去朝鮮執勤沒什麼問題，但時間久了肯定也不行。
海軍第一營無法長時間離開渤海，那就隻能繼續擴編海軍規模了。
既然遲早是要擴大海軍規模的，朱由校咬咬牙乾脆再組建海軍第三營，隻是目前隻能承受兩個千戶所的編製，不是沒錢糧，而是沒有風帆戰艦與火炮，朱由校又不想將就使用福船、沙船那些老式海船。
一個千戶所駐守濟州島，另一個千戶所駐紮永宗島，至於影島，暫時交由四海拓殖駐防即可，他們可是有四個千戶所的水兵的，而且戰船與武器配備要比渤海水師、朝鮮水師甚至日本水師要強上不少。
既然要在濟州島設立第三營，乾脆再新增一個造船廠吧，反正船木基本都是要從遼東運過來，而且未來還要到鯨海北部的遼東之地砍伐樹木，不用再大老遠運到天津了。
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