一種是和斑大戰之後，太過虛弱，身體透支而死，理由是，柱間被穢土後，是他中年的樣子，因為穢土轉生出的人的相貌就是死前的相貌，你看三代和四代，死的時候什麼樣子被穢土就是什麼樣子，所以柱間就是那之後不久死的
但是也有觀點認為，柱間既然已經有了孫女綱手，而柱間是在忍村建立之後才和漩渦水戶結婚，所以柱間在忍村建立後肯定活了很久很久，因為就算他兒子18歲生綱手，綱手再長個五六年，他就是在木業村建立30年後死的
但是觀點二也有漏洞，假設柱間30歲建立忍村，他就是60歲死，那麼二代接替柱間也差不多50多歲，但是二代在委托袁飛的時候，年齡也不大
我再補充一點，自來也剛出場設定是50歲，三代享年69歲，綱手大蛇丸自來也年齡相差應該不大，也就是說綱手也是50歲左右，也就是說綱手是在猿飛20歲出生的，但是他媽的袁飛20歲已經被委任3代火影了，那時候初代還不死?不僅不死，還陪小綱手渡過一個快樂童年，二代都gg了，初代還能多活10年陪小綱手?
個人比較傾向於柱間是在終結之穀跟斑的戰鬥之後重傷不治而亡，也可能是在終結穀後得了重病不治而亡，隻有這兩種可能。
而這麼推斷的理由也很簡單，因為以千手柱間的實力，完全可以說是當世無敵，所以他必然不可能是被其他人殺死的，因為沒人能殺得了他，那麼他英年早逝的原因隻有兩種可能，一種是得了重病，治不好，死了，這個沒辦法，千手柱間再厲害他也還是人，超級賽亞人都能死於心臟病，忍者之神死於絕症好像也沒什麼毛病，而且火影裡也不是沒有案例，君麻呂就是死於絕症，雖然千手柱間實力遠超君麻呂，但是單論身體素質，真強不了多少，畢竟忍者都是脆皮，斑站在忍者之巔，也被一刀捅死了。
而除了得絕症以外，也就隻剩下因為跟斑的大戰留下了嚴重後遺症，然後後遺症爆發而死這個可能了，畢竟終結穀打的那麼慘烈，留下不治之傷也是很可能的。
除了這兩種可能以外，柱間不太可能有其他的死法。
而柱間死亡的時間，我個人認為是在終結穀之後不久，最遲也是二代上位之前，甚至有可能斑前腳剛走柱間後腳就跟上去了。
想象一下淨土大門前他倆的對話。
柱間：馬達拉，等等我，我和你一起進去。
斑：咳咳，那什麼，哈希拉馬，你還是自己去吧，我就先回去了。
說完伊邪納岐發動斑原地複活。
柱間：了，千手柱間根本不可能見過綱手，眾所周知，火影的時間線是不能細究的，因為一細究整個故事都要崩盤了，比如著名的月光疾風兩歲入學事件，以及彌彥死後長大十歲事件。
而且事實上原著也有一個細節可以證明柱間在扉間上台之前就死了。
原著裡四個火影被穢土出來後大蛇丸指責二代把警衛部門給宇智波是不安好心，然後初代很憤怒的指責二代這麼做完全是不信任宇智波，這代表柱間對此根本毫不知情，而警衛部門這麼重要的職位應該是建村初期就設置好的，不太可能建村很久以後再設置，你能想象一個國家建立以後不立刻設置警察，而是要等到多年以後再設置？
所以扉間當上火影時柱間肯定已經是死了，不可能是柱間活著退位給扉間。
考慮一個問題，柱間有一個被動技能，受傷不用結印，自動就可以恢複，而且是，很快啊，很快，一眨眼的事。這歸功於什麼？柱間細胞，說明柱間細胞具有極快的分裂分化能力的。
第二，大蛇丸和團藏他們用柱間細胞做人體實驗，那個時候柱間已經死了多久了，而他的細胞離體後還能堅持那麼長時間，一直在裂殖，一直可以被培養，說明柱間細胞具有無限裂殖能力。
然後看一下接種了柱間細胞的人，團藏，帶土，馬達拉，移植部分都發生了不同程度變異——白色的胳膊。大和是個例外，他可能整體都變異成柱間細胞了，不表現出來。
綜合下來，快速分裂，無限裂殖，這是個癌細胞啊。柱間細胞就是癌細胞，發生變異的癌細胞，而且是可以產生木質素，纖維素的癌細胞。
一個渾身都是癌細胞的人能活到多久，病死不是很正常嘛，成也細胞，敗也細胞。
而突變的畢竟是個例，所以千手一族隻有他一個人會木遁。
要說為啥哈西辣媽全身都變異了，也許是喝核廢水了吧。
代火影到底是怎麼死的不知道，但是有一點很明確，初代火影死的時候，就是斑看眼輪回眼的時候。
雖然不知道柱間怎麼死的，但是死在終末之穀一戰之後，是毫無疑問的，所以，猜測柱間的死因的話，很大可能是因為狂犬病的原因。
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