王允怒道：“董卓是逆賊，如今伏誅，士民無不歡慶。”
“這是什麼人，竟敢為他哭？”
於是命武士：
“把那人給我抓來！”
不久，那人被擒至眾官麵前，眾人見後無不震驚，原來此人竟是侍中蔡邕。
王允斥責道：
“董卓是逆賊，今日伏誅，是國家的大幸。”
“你身為漢臣，不為國家慶賀，反而為賊哭泣，這是為什麼？”
蔡邕伏罪道：
“我蔡邕雖然無能，但也知道大義，豈會背叛國家向董卓效忠？”
“隻是因為一時感念他的知遇之恩，不覺悲泣罷了。”
“我自知罪孽深重，願大人赦免。”
“如果能黥麵刖足，讓我繼續編修漢史，以贖罪孽，那便是我的幸事。”
眾官因惜蔡邕才華，紛紛為其求情。
太傅馬日密勸王允道：
“蔡伯喈乃曠世奇才，若能續成漢史，實為盛事。”
而且他素來以孝行聞名，若貿然殺之，恐怕會失去人心。”
王允卻說道：
“當年漢武帝不殺司馬遷，任其作史，結果留下謗書，流傳後世。”
“如今國家氣數已衰，朝政混亂，不能讓小人執筆在幼主左右，否則我們將被他汙蔑於後世。”
馬日無言而退，卻私下對眾官感歎道：
“王公恐怕會絕後吧！”
“善良之人，是國家的根本；文史之作，是國家的典範。”
“滅根廢典，國家怎能長久？”
當時王允不聽馬日之勸，最終下令將蔡邕投入監獄，縊死獄中。
一時間，士大夫聞者皆為之流淚。
後人論及蔡邕為董卓哭泣，固然有不對之處，但王允將他殺死，也未免太過。
有人作詩歎道：
董卓專權肆不仁，侍中何自竟亡身？
當時諸葛隆中臥，安肯輕身事亂臣。
且說李傕、郭汜、張濟、樊稠逃至陝西，遣人至長安上表請求赦免罪過。
王允說道：
“董卓的專橫跋扈，全是這四人助紂為虐所致。”
“如今雖大赦天下，但唯獨不能赦免這四人。”
使者回報李傕。
李傕說道：
“既然求赦無望，我們各自逃命便是。”
謀士賈詡勸說道：
“諸位若是拋下軍隊獨自逃亡，那即便是一個亭長也能將你們縛送官府。”
“不如聚集陝地百姓和你們的本部軍馬，殺回長安，為董卓報仇。”
“如果成功，就奉朝廷之名平定天下；若是失敗，逃跑也不遲。”
李傕等人采納了他的建議，遂在西涼州散布流言道：