這係列故事自然來自奇跡先生的家鄉，他為了說給三匹幼駒聽做了不少刪改，比如一些明顯少兒不宜的情節。在設定上，他也做了很多修改，以符合小馬利亞的世界觀。
原著的瓊斯有一個最大的問題，那就是身為考古教授，乾的卻全是盜墓的事，拿了彆國的寶物全送到自己國家展覽，而真正的考古學家隻會進行保護性發掘。所以為了給三匹幼駒傳授正確的觀念，奇跡先生改成每一次都是反派先行動，寶物出世後瓊斯才不得不出動，奪回寶物後也都物歸原主，從哪來回哪去；沒能力保管的，才會簽訂協議代為保管。
這也算是他向自己故鄉的，廣大的實乾考古學家的敬意。
聽完蘋果麗麗解釋，穗龍說：“這點倒是和無畏天馬不一樣。無畏天馬每次冒險完，都會拿走寶物自己保管，以免重新落入敵手。”
三匹幼駒繼續解釋第一部《法櫃傳奇》的劇情，當然經過了較大魔改。故事中的印第馬納·瓊斯是一個虛構小馬國家的大學教授，專門教授曆史、神話和小馬學，但他不止是一個看上去文弱的學者，實際上體格強健、正義勇敢，招牌裝束是棕色夾克、軟呢帽、鞭子和一把能發射奇特子彈的武器，名為“左輪蹄槍”。
“等等，和無畏天馬好像。”穗龍打斷道。“這個故事該不會是抄襲無畏天馬的吧？”
“誰抄襲誰呢？”蘋果麗麗說。“奇跡先生說這個故事，在他出生前二十多年就有了。聽說·k·葉琳很年輕，不可能有四十多歲吧？興許是她從哪裡聽到了瓊斯的故事，自己再改的也說不定。”
“你這話可千萬彆被雲寶聽到，不然她要發飆的！”穗龍和醒目露露一起警告道。
“行行行，總之穗龍你聽我講就是了。”
在《奪寶奇馬》中貫穿始終的反派勢力，是一個名為“許德拉”的邪惡集團，那些邪惡小馬妄圖通過收集各種魔法寶物獲得無以倫比的力量，從而統治世界。第一部故事開始，瓊斯就從自己的信息渠道得知，有一件名為“法櫃”的神奇寶物，裡麵存放著可以驅逐任何魔物的“上古卷軸”。上古英雄就是用這個卷軸驅逐了風之魔，這才有了瓊斯所處的安康盛世。
顯然這個故事經過了非常大的魔改，但管他呢，精彩就行了。印第馬納·瓊斯猜測許德拉之所以想奪走法櫃，就是想用其中的上古卷軸放出所有魔物，為己所用。而破解法櫃所在位置的關鍵，就是一柄寶石權杖，隻有它的高度、寶石材質，才能讓陽光以特定角度射入地下宮殿，從而打開大門。
寶石權杖的杖頭一個名為瑪麗安的雌駒身上，她父親是當地的祭司，過世後將杖頭交由她保管。瑪麗安知道有許多壞蛋覬覦法櫃，誤把瓊斯當作許德拉一夥，起初堅決不配合，後來瓊斯在危急關頭，不顧杖頭先救她，才令她意識到這個家夥是正派，同意並肩作戰。
兩匹小馬拿到杖頭，本以為許德拉沒有杖頭就無計可施；沒想到許德拉竟然複製出了杖頭和杖柄，似乎就要成功。他們怎麼做到的？原來在當初杖頭爭奪戰中，杖頭誤入火中，一個許德拉頭目不管三七二十一直接上蹄子抓，杖頭的紋路深深烙在他的蹄子上，而提示正在其中。
許德拉雖然似乎有了正確的權杖，但不想放過瓊斯這個死對頭，變著花樣害他，他和瑪麗安起初配合默契，屢屢化險為夷，其中最歡樂的橋段，莫過於一槍放倒一匹舞刀弄槍的肌肉壯馬；可在最後一次襲擊中，瑪麗安不幸被擄走，瓊斯隻好深入虎穴營救隊友。在此期間他得到當地一位文字大師的指點，明白杖頭的提示在兩麵，結合起來才是杖柄的正確長度。許德拉頭目隻在蹄子上烙上了一麵，沒有另一麵，當然複製錯了。
那邊許德拉使用複製的權杖始終一無所獲，弄明白尺寸出錯了，還得找瓊斯拿真杖柄。原著中瓊斯按捺不住好奇心，自己用權杖找到了法櫃，而奇跡先生為了塑造更正義的考古學家形象，改為他始終試圖隱藏杖頭，沒有權杖就找不到法櫃，他的目的僅此而已。
然而許德拉以瑪麗安作要挾，瓊斯不得不屈服交出杖頭，但他留了個心眼，故意交了個假的複製品，卻沒想到當地一個小馬為錢背叛，告知了許德拉真品位置。許德拉怒火中燒，將瓊斯和瑪麗安丟入先前按錯誤方向挖的密室中。
中間自然是一係列緊張刺激的解謎逃脫，兩匹小馬有驚無險地解開所有謎題，順利逃到地表，但許德拉已經挖出法櫃前往世界最高山峰。這是因為在最高山峰有一處時空裂縫，上古卷軸在那裡能爆發出最強魔力。
瓊斯和瑪麗安經過一番努力沒能及時前往，卻意外在瑪麗安家中找到她父親遺留的信息。經過解謎，兩匹小馬得知隻有擁有祭司血脈的小馬才能直視上古卷軸，否則會引發災難性的後果。
為了避免這個後果，他們必須阻止許德拉，即使知道他們已經無法達到最初的邪惡目的。他們遇到了雪山龍族，他們也知道上古卷軸的秘密，事實上，早在上古英雄放逐風之魔之前，他們就已經用卷軸放逐過世界吞噬者。
他們贏得了雪山龍族的信任，在巨龍的幫助下，他們及時到達最高山峰，但許德拉的邪惡小馬們並不相信這套說辭，執意打開法櫃使用上古卷軸。果然，瑪麗安父親說的可怕後果出現了，數不清的魔物重返世界，許德拉的邪惡小馬們也被上古卷軸的魔法奪走了視力。邪惡小馬們妄圖使用掌控這些魔物，但全是徒勞。
為了拯救世界，雪山龍族於天空翱翔拖延魔物，瑪麗安衝上去使用上古卷軸，因她是祭司的子嗣。可惜她當初就沒有仔細聽父親教導，麵對卷軸不知道如何是好，為了幫助她，瓊斯冒著瞎眼的風險衝上去，幫助她回想起卷軸的咒語。
最終瑪麗安成功使用卷軸，重新封印了所有魔物，世界重回安寧，瓊斯也沒有失去視力，皆大歡喜，除了許德拉的這支小隊因邪惡行為受到了永久的懲罰。
巨龍帶著法櫃回到瑪麗安的家鄉，法櫃重新妥善安置，而紅寶石權杖也物歸原主。瑪麗安想要和瓊斯一起冒險，原來她早已在冒險中喜歡上了他，但他隻是一笑而過，說她在她的家鄉有自己的神聖職責，以後他們有緣再見。
穗龍聽完，情不自禁地鼓起掌，“太棒了，太棒了！我敢說這故事比《無畏天馬》還要精彩！”但隨即他又疑惑道：“可這故事聽起來就很長，我們怎麼能在·k·葉琳出新書之前寫完呢？”
“沒關係，我們可以分篇連載。”蘋果麗麗說。“先在能找到的所有報刊上投稿，先吸引一批忠實讀者。之後就算葉琳那邊出書，我們這邊也有基本盤。”
“為了寫好這部書，我們必須深入學習寫作技巧。”醒目露露說。“穗龍，有什麼辦法嗎？”
“當然有了，你也不看這是哪兒？”穗龍說著，指向背後的金橡樹圖書館。“我知道有幾本指導寫作的書，我們可以參考來看。”
……
幾天後，遠征歸來的紫悅、雲寶等小馬依舊回味無窮，因為她們不止見到了最負盛名的作家，·k·葉琳，還得知了她最深的秘密——她就是無畏天馬本尊。書中的情節全部來自她的真實經曆，還有什麼比這更令馬激動的呢？
當然，最直接的收益是葉琳的書不延期了，這對所有書迷都是好事，除了可愛軍團。紫悅她們進入小馬穀時，發現許多小馬都在看報，有喝下午茶看入迷的，甚至茶喝完了都不知道。
雲寶借來一份仔細觀看，大跌眼鏡。“‘《奪寶奇馬：法櫃傳奇》第一章——神奇的考古學家’？！這是怎麼回事？”
紫悅也借來一份細看，一下子就被吸引住了。“和《無畏天馬》的題材好像，但主角卻截然不同。一個找到寶物後總是物歸原主，另一個——呃……”
“她那是代為保管！”雲寶糾正道。“這很明顯是對《無畏天馬》的拙劣模仿。我得告訴葉琳，有小馬抄襲她！”
“慢著，親愛的雲寶。”珍奇說。“彆那麼武斷，仔細看看吧。我倒覺得隻是題材類似，故事完全不一樣。”
“比如我在這個故事裡，看到了團隊協作。”蘋果嘉兒直言。“而且瓊斯物歸原主的目標，很吸引我。”
“而且瓊斯是個陸馬，喲吼！”碧琪歡快地大聲叫道。“咱們陸馬也有自己的冒險主角了。”
“而且，嘻嘻，我覺得裡麵還會有愛情故事……”珍奇看著看著，咯咯直笑。“不知道他和瑪麗安會怎麼發展呢？好期待！”
“你們都是怎麼了？我們不應該支持葉琳嘛？”雲寶不滿地說，隨即向紫悅尋求支持。“紫悅，你說呢？”
“呃，我想你可以暫時放下偏見，好好看看這部作品。”紫悅相當客觀地說。“我認為喜歡瓊斯，並不影響喜歡無畏天馬。他們倆都是十足的冒險家，各有各的魅力。”
柔柔補充道：“這是好事呀，在下一部《無畏天馬》出來前，你也有彆的故事能看了。”
雲寶聽了，有點動搖，但她忠誠的屬性決定她不會輕易“改弦更張”。“算了，你們愛看就看吧，我沒理由阻止你們。不過我絕無可能背叛‘葉琳’！”
“雲寶，沒必要這樣。”紫悅勸道。“我喜歡《無畏天馬》，也崇拜葉琳，但我到現在也讀了數不清的書。另讀其他書，並不代表你對那個作家不忠誠。”
“你這樣勸沒用，得看我的。”碧琪小聲對紫悅說，同時調皮地眨了眨眼，隨即大聲對雲寶說：“雲寶，我理解你的心情。也許‘批判性’地看一下，能讓你找到它‘抄襲’的證據呢？”
雲寶聽罷，嘴唇蠕動，好一會兒才說：“嗯……也許的確可以‘批判性’地閱讀……那我就‘勉為其難’地看看……好了。”
眾小馬都笑了——雲寶當初入坑《無畏天馬》時，也是起初拒絕，後麵一發不可收拾。紫悅看著作者欄署名為“印第馬納·瓊斯”，似乎是個虛構的小馬名字，總不可能瓊斯也和葉琳一樣，寫的全是自己的親身經曆吧？
紫悅看過的書比一般小馬吃過的鹽都多，很容易在字裡行間中找尋線索。有些特定文段的寫作技法，很符合圖書館裡的某些藏書教授的技巧；而文風，她看出是四個作家交替完成，其中一個文風她很熟悉，隱約猜出是誰。
但她沒有說出來，隻是挑眉一笑。就讓他們以瓊斯的名義繼續寫吧，她知道這會是一個很有趣的係列。