曆史上，奢安之亂明朝共計花費了十七年，動用軍力超過二十萬人次，耗費銀餉無數，百萬人口流離失所，財產損失無計其數。“奢安之亂”規模巨大、持續時間長，不僅震撼了當時的西南各省，牽製了蜀、楚、黔、滇諸省的軍事、經濟力量，削弱了明王朝對後金的防禦能力，在客觀上也起到了減緩明朝廷對李自成等農民起義軍的壓力，使明朝廷處於三線作戰腹背受敵的境地，在很大程度上動搖了明王朝的統治基礎，加速了明王朝封建統治的覆亡。因此，這次土司叛亂對明末清初西南民族社會影響較為深遠，甚至也直接影響到了西南曆史發展的進程。
然而，就在這個時空裡，由於朱由校高瞻遠矚地提前布局謀劃，這次平定叛亂竟然僅僅耗費了兩年整的時間，便成功殲滅了奢安勢力的主力軍。
由於朱由校果斷確立了以朱燮元作為統管雲南、貴州、四川三省事務的總負責人這一重要製度安排，並早早著手運輸了數以百萬計的銀兩和糧食等戰略物資。朱燮元在得到了極為充裕且堅實可靠的後勤保障支持，進而能夠在極短的時間內在西南三省迅速集結起多達十五萬之眾的龐大軍隊。憑借著這種具有壓倒性優勢的強大兵力，他們逐一擊破了奢崇明所率領的十萬大軍以及安邦彥統領的另外十萬大軍。
可以想象，如果奢崇明和安邦彥兩人能夠協同一致、同時發動叛亂行動的話，那麼即便朱由校已經事先精心布局籌謀，再加上朱燮元這樣足智多謀的將領指揮應對，要想平息這場叛亂所需付出的努力也必將呈幾何倍數般地急劇增加。
受到這場叛亂的嚴重衝擊和影響，四川省和貴州省兩地總共約有三十萬名無辜百姓被迫背井離鄉、四處流浪漂泊，更有十多萬民眾因此失去了自己賴以遮風擋雨的溫馨家園。而且，這場激烈戰事的戰火還蔓延波及到了四川省大約三成的遼闊地域，以及貴州省將近四成的廣袤疆土。
朱燮元抓住時機，雷厲風行地推行起改土歸流政策來。這片七萬多平方公裡的廣袤土地上，一場前所未有的變革正在悄然展開。
他大刀闊斧地設立新的州、府、縣，有條不紊地規劃著每一寸土地。與此同時，他還巧妙地鼓動當地的土民們擺脫土司的束縛，紛紛投身於這些新興的行政區域之中，開啟全新的生活篇章。使得在全國還未開展的普查，在經過朱燮元的改土歸流政策的實施下，四川、貴州在天啟四年底，徹底清查了所有的人口、田畝之事。根據普查結果，四川共有民八百萬人，田畝五千二百萬畝，比萬曆六年普查時多了將近三成。貴州人口八十萬，田畝五百萬畝。
然而，朱燮元的這一係列舉動卻猶如巨石入水，激起千層浪。原本就對權力更迭心存不滿的西南土司們，此刻更是感到自身地位受到嚴重威脅，局勢變得越發不穩定起來。而這種不安情緒最終醞釀成了另外一場巨大的風暴——雲南滇南阿迷州土司普名聲和安南土司沙定洲聯手發動叛亂，這場動亂被後世稱為“沙普之亂”。不過這也是後話了。
儘管此時仍有少量奢安叛軍如無頭蒼蠅般在西南各省間流竄滋事，但總體形勢已然得到有效控製。朱由校對於西南戰事所取得的成果給予了高度肯定，認為這是一次具有重大意義的勝利。
戰後，朱由校與內閣經過一番深入商討，決定再次打破常規，對在此次平叛行動中有出色表現的官員予以重賞。這份殊榮不僅是對他們英勇奮戰的褒獎，更是激勵更多人為國效力、保家衛國的動力源泉。
皇帝下旨、內閣與通政司用印，正式冊封朱燮元為山陰伯，這一殊榮不僅彰顯了他卓越的功績，更是對他忠誠與才能的高度認可。而朱燮元的嫡長子朱兆宜，則順理成章地被封為世子，成為家族榮耀的繼承者。與此同時，朱燮元的另外三個兒子——朱兆寧、朱兆憲和朱兆宣也都獲得了正三品上輕車都尉的武職封號，可謂一門顯赫，榮耀加身。
另一邊，同樣因平叛之功受封的還有巾幗英雄秦良玉。她被冊封為忠貞伯，展現出女子亦能保家衛國的非凡氣概。而她的獨子馬祥麟則獲封世子，延續著家族的榮光。
此次平叛之戰中，眾多大臣皆立下赫赫戰功，皇帝自然不會虧待他們。於是，紛紛論功行賞，給予豐厚的賞賜。令人稱奇的是，這些大臣們的子嗣也得到了特彆的恩賜，皆被朱由校降下恩旨召入京師，並得以加入新軍，開啟新的征程。
再說那參與平叛的二十萬大軍，在朱燮元的英明領導之下，順利地平分了朱由校所封賞的五百萬兩銀子的巨額賞金。朱燮元深知這場戰亂給四川、貴州等地帶來了嚴重的民生問題，百姓流離失所，饑荒遍地。為解民困，他毅然決定將軍隊拆撤一半，讓士兵們返回家鄉務農，以恢複當地農業生產，緩解民眾的恐慌情緒。此舉既體現了朱燮元的深謀遠慮，又展示了他心係百姓的仁愛之心。
在朱燮元和王三善這兩位傑出官員的英明領導之下，四川和貴州這兩個省份終於迎來了久違的寧靜與平和，也逐漸踏上了休養生息之路。趁著免稅兩年這個難得的機遇，這片土地猶如久旱逢甘霖一般，開始慢慢恢複生機。
那些曾經失去土地的窮苦百姓以及當地的土民們，如今都滿心歡喜地在新分配給自己的肥沃田地上辛勤勞作著。他們彎著腰，低著頭，汗水浸濕了衣衫，但臉上卻洋溢著對未來生活充滿希望的笑容。每一滴汗水滴落在土地裡，仿佛都孕育著豐收的喜悅。
而另一方麵，經過大規模的裁軍行動之後，原本數量眾多的兵馬隻剩下了七萬餘人。然而，就是這剩下的七萬土漢兩族士兵，在提督杜文煥的嚴格訓練下，每日刻苦操練，不敢有絲毫懈怠。儘管這些士兵們心中對於西南地區為何能夠保留如此規模龐大的兵力感到疑惑不解，但又有哪位將領不希望自己手中掌握更多的軍事力量呢？畢竟，擁有足夠強大的軍隊才能更好地保衛一方平安！
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