波特三人在得到了馬爾福提供的線索後又通過尋找詢問成功得到了那個不幸死去的學生的信息和最後被發現的地點——二樓的廢舊女盥洗室，也是赫蒂被發現的地方。
幾次前去，除了一個叫哭泣的桃金娘的鬼魂外，波特都沒有發現其他有價值的線索，直到一月底，他在這兒撿到了一本日記。
2月14日是情人節，但今年的情人節格外的冷清，因為密室的原因，可這依舊抵擋不住洛哈特收到了一大堆的情書和禮物。
這個虛偽又自戀的所謂黑魔法防禦教授，就沒有好好上過一節課，反而對如何吹噓和炫耀自己非常的在行。除了他的粉絲外，已經沒幾個學生喜歡這個教授了，就連其他教授也都對洛哈特頗有意見。
洛哈特舉行了一個情人節的慶祝活動，而波特收到了一封匿名的情人節賀卡和一首歌曲，令他無比生氣的是，洛哈特竟要求他也當眾讀出來，就像他自己在一個個讀粉絲所送的情書。
這對於波特來說是極其糟糕的一天，可這天也令他發現了那本撿回來的日記的秘密，隻要在上麵寫字就會有人回複。
波特開始向日記詢問關於密室的事，日記裡的靈魂帶著他查看了自己的記憶。
50年前，在那個學生被發現死了後，這個靈魂——裡德爾發現了仍然是學生的海格養了一隻名叫阿拉戈克的蜘蛛，他認為這就是造成密室事件、殺死學生的罪魁禍首。
攻擊事件還在繼續，越來越多的學生被發現石化，霍格沃茲已經麵臨閉校的局麵，魔法部部長派人帶走了鄧布利多，並把海格作為嫌疑犯抓進了阿滋卡班。
波特和韋斯萊穿著隱形鬥篷趕在海格被抓前詢問他有關密室的事，但他隻來得及告訴他們跟著蜘蛛就能找到答案。
波特和韋斯萊跟著蜘蛛進入禁林，見到了阿拉戈克。阿拉戈克告訴他們，自己並不是五十年前殺死學生的凶手，而密室中的怪物則是它們的死敵。
然而，阿拉戈克的子女蠢蠢欲動，它們想要把波特和韋斯萊吃掉，但他們在開學時弄丟的會飛的福特安格裡亞車的幫助下，成功逃出了禁林。可等到他們回來後便發現了另一個噩耗，赫敏也被石化了。
他們來到醫療翼看望赫敏跟赫蒂時，發現了她手中緊捏著一張被撕下來的書頁，可就在這時，更讓人害怕的事情發生了。城堡的牆上出現了一行字，寫道“金妮·韋斯萊已經被帶進密室，而且她的屍骨將永遠留在密室”。
波特迅速來到了哭泣的桃金娘的盥洗室，在這裡，桃金娘終於願意告訴波特跟韋斯萊關於她自己的死因。這也揭開了50年前塵封的密室殺人事件，她就是當時那個死去的學生。在桃金娘的幫助下，波特順利找到可了密室的入口。
可鄧布利多和海格都被抓走了，波特兩人便想要找洛哈特來和他們一起進入密室，畢竟洛哈特曾經經曆過這麼多驚心動魄的冒險。
可沒想到，波特兩人到洛哈特時發現他正準備逃跑，在兩邊爭吵時，令波特終於發現了卻洛哈特實際上隻是一個盜用他人成就的騙子。儘管如此，他們還是搶走了洛哈特的魔杖，逼迫他跟著他們一起行動。
來到地下後，洛哈特趁兩人不慎直接搶過韋斯萊的魔杖，他試圖清除兩人的記憶，但韋斯萊的魔杖毀壞了發生了回火，導致洛哈特自己的記憶被清除了。
但時間緊迫，波特跟韋斯萊也沒有時間再管他，兩人就這麼繼續前進。終於，他在發現了昏迷的金妮，還見到了自稱是“記憶”的湯姆·裡德爾。
波特在從和裡德爾的對話中得知，密室是金妮在裡德爾的控製下開啟的，他現在之所以可以離開日記也是靠吸取金妮的生命。而這個湯姆·裡德爾，就是之後的伏地魔。為了在離開學校後仍然能打開密室，伏地魔在日記中保存了一個十六歲的自己。在五十年前，也是他將海格陷害的。
裡德爾在坦白完這些便放出了蛇怪，希望讓它殺死波特。但好在鄧布利多的鳳凰福克斯及時帶來了分院帽，波特從帽子中抽出了格蘭芬多的寶劍，殺死了蛇怪。但與此同時，一顆蛇怪的毒牙也紮進了哈利的胳膊。波特趁著意識清醒，用斷掉的毒牙摧毀了日記，喚醒了金妮。而鳳凰的眼淚也幫哈利治好了蛇怪的咬傷。
密室到這裡也算徹底結束了，等到波特三人從密室成功出來後才想起來最初的問題，這本裡德爾的日記究竟是怎麼被金妮一個小姑娘這麼輕易就得到了？
家養小精靈多比及時出現，暗示了波特，從而引出了馬爾福的父親盧修斯·馬爾福，他在那次對角巷的洛哈特簽售會上，故意將日記偷偷塞進金妮買書的籃子中。
而盧修斯見自己暴露了竟要直接殺了波特，卻被多比給打斷了，這也讓波特更加確定，盧修斯就是食死徒之一。
他不禁想起馬爾福，一個食死徒的兒子，注定就是個食死徒嗎？如果是以前他也許會認為是，但現在，他也不能確定了
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