對於這個傑出的科技人才，木葉經過討論後決定封印他的力量，讓他留在木葉研究院繼續為村子的建設添磚加瓦，為忍界的科技進步獻上一份力量。
至此，宇智波斑所發動危及整個忍界的戰爭徹底結束。
而沒有了隱於暗處的黑絕搞風搞雨，輝夜姬想要再次重現忍界的可能性已經無限接近於零。
隱藏在忍界暗處的最大不安定因素已經被掃除，不久之後佑介和水門也著手進行統一忍界的計劃。
對於統一忍界，最大的問題的並非是木葉的武力是否足夠，而是需要儘量減少戰爭，以及收服其他勢力之後如何安撫的問題。
這一點木葉在實施計劃前早就有所準備，決定從木葉以及砂隱開始實行佑介所提出的「三權分立」和「最高議會」製度，這兩個製度也是來源於佑介前世。
雖然這兩個製度是由佑介提出，但是也經過木葉所有高層群策群力進行了完善。
簡單來說，「三權分立」就是將行政權、司法權和軍權分彆獨立，讓三大機構的權利分散，不會集中在同一個人或是同一個機構下。
行政權由大名負責，司法權由新增職位司法部長負責，而軍權則由影來負責。
而「最高議會」則是將最高管理層組織為議會的形勢，所有的高層決策必須通過議會來表決。
議會的成員，則由各個機構中的高層擔任，自然也包含了大名、司法部長以及影。
其中大名擔任議會的榮譽議長，但實際在議會中的話語權與其他議員沒有區彆。
雖然這兩套法案依然會有不少弊端，但是隻要沒有個人武力足以對抗國家的絕對強者來擾亂秩序，那麼便能夠保證新建立的國家可以處在一個平衡穩定的狀態，無論是大名還是影，都不可能獨斷專行。
依照這種管理模式，火之國首先將已經在控製之下的的風之國吞並，風之國大名降為大臣，而風影的職位也被取消。
等到將周邊的忍者效果吞並後，火之國憑借絕對的武力繼續成功占領了水之國、雷之國和土之國。
這個過程大約曆經了五年，至此整個忍界幾乎已經都處在火之國的掌握之下。
原火之國的統治區域成為了整個忍界的中心，而木葉村也代替了原火之國都城，擴建之後成為了新的首都，改名為木葉城。
木葉城的中央，一座宏偉的人形雕像高高矗立著。
這座雕像身穿木葉的製式忍者馬甲，外麵披著一件白色的大褂，手中拿著一柄袖長的武士刀，正是佑介本人的形象。
雕像下有一座石碑，上麵刻著佑介這些年來為木葉所作出的貢獻。
例如整頓宇智波一族和警務部、建立木葉研究院、帶領木葉戰勝曉組織和砂隱村的襲擊、戰勝掌握六道之力的宇智波斑拯救忍界、為木葉統一忍界做出巨大貢獻等等。
原本佑介對於建造雕像這種個人崇拜主義的作為是反對的，不過在木葉眾人的強烈支持之下，以及想到自己也很快就要離開這個世界，這座雕像也許就是自己在這個世界存在過的最後證明，佑介最終同意了。
......
在木葉城佑介的家中，泉美、母親宇智波葉月、鼬、兜、鞍馬八雲和水門六人都麵色哀傷的看著佑介，其中有幾人眼睛還異常的紅腫著，顯然是剛剛大哭過。
雖然已經聽說佑介找到了力量更高的世界，要前往新的世界去探索，但大家還都是希望他能夠改變想法留在忍界。
不過可惜的是，無論他們如何的勸說，最終也沒能改變佑介的心意。
在家中的佑介穿著一身輕便的武士和服，腰間挎著流刃若火，而他現在的左眼竟然變為了輪回眼的圖案。
這一隻輪回眼自然就是宇智波斑臨死前剩下的那一隻。
原本出於增強瞳力的目的，佑介用左眼直接吸收了這隻輪回眼。
但是沒想到的是，這隻輪回眼竟然與左眼發生了融合，讓他的左眼同時具有了輪回眼的一些瞳術。
並且這隻輪回眼融合之後，依然可以在上麵映現出佑介的寫輪眼和萬花筒寫輪眼，正常使用他現有的瞳術。
在忍界需要做的事情都已經做完，佑介也準備在今天離開。此時的他，正一臉微笑的和眾人做最後的告彆。
“我隻是去追尋自己的武道而已，你們不用太過悲傷。這些年來，和大家共度的美好記憶，我也會永遠的留在心中。”
目光一一看過眾人，佑介將手中的斬魄刀緩緩抽出，隻不過這一次他拿著斬魄刀的方向與以往相反。
聽到佑介的話，眾人反而更加的悲傷了，宇智波葉月、泉美和鞍馬八雲三人都忍不住再次哭了起來。
現在的佑介其實也隻是強撐著笑容而已，他何嘗不是對眾人充滿了不舍。
不過想到自己追求更高力量的夢想，佑介還是狠下了心，將斬魄刀刀柄的尾部正對著按上了自己的眉心。
“魂葬！”
一陣晶瑩柔和的白色光芒亮起，佑介的肉身竟然燃燒了起來，而靈魂則是緩緩的在忍界消失。
佑介最後看了一眼自己得親朋摯友，他們的臉龐也永遠的印在了他的記憶之中。