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最終進入半決賽的四人，分彆是武藤遊戲、海馬瀨人、馬利克和琪莎拉。
在淘汰賽中，由於好基友利希德的昏迷，馬利克的暗人格出現。暗馬利克性格狂暴，肆意妄為，使用千年錫杖的能力讓他的對手在戰敗後陷入了昏迷之中。
武藤遊戲幾人，對他的這種行為十分厭惡，決心要在這場決鬥中擊敗暗馬利克。
在飛艇之上，武藤遊戲早已從夏迪那裡得知，如今能打開他記憶之門的三張神之卡和七件千年神器都集合在這裡，但卻不知道還剩下的一張神之卡拉的翼神龍隱藏在哪裡。
一開始是一場大亂鬥，四人混戰並未能分出勝負，僅僅是確定了各自的對手。
武藤遊戲與馬利克對戰，而琪莎拉的對手自然就是海馬瀨人。
第一場戰鬥，是武藤遊戲與暗馬利克的對戰。乘坐者電梯，眾人登上了位於高塔頂端的決鬥台上。
歐貝裡斯克的巨神兵的實力，眾人已經見識過了。無論是破壞對方場上所有怪獸，並給與其4000點生命值的效果；還是將自己攻擊力提升到無限大的效果，都是十分恐怖的。
武藤遊戲的幾位好友都不由的為他捏了把汗，在他走上決鬥台之前，為他鼓足了勁。
在海馬瀨人和伊西絲的戰鬥之後，伊西絲向眾人講述了守墓一族的往事，大家都知道了馬利克為何會如此憎惡武藤遊戲。而武藤遊戲雖然不知道當初發生了什麼事情，會賦予守墓一族這般使命，但他內心之中也有一些內疚，所以他想要拯救被暗人格操控的馬利克。
“馬利克，我會在這場決鬥中打敗盤踞在你內心的邪惡靈魂！”武藤遊戲手握著剛切洗完成的卡組，緊盯著對麵的馬利克說道。
武藤遊戲的話，並未對馬利克造成任何威脅，他表情怪異的笑著“哈~~哈~~哈哈，是嗎，那就讓我來試試吧！”
語畢，馬利克使用了千年錫杖的能力，將決鬥遊戲轉化成了黑暗決鬥。黑色的迷霧將整個決鬥場地環繞起來，所有人都被黑暗所籠罩。
在兩人的場地上空，分彆出現了兩個人的靈魂被禁錮在他們的左上方，這兩個靈魂自然就是兩人的表人格。
“搭檔，你怎麼會出現在這裡！！”看著出現在做自己左上方的表人格，武藤遊戲有些震驚。
發現了他麵部表情的變化，馬利克怪笑道“你看到了吧，這就是送上來的新鮮祭品！”
“馬利克，你到底想要做什麼！”看著自己的表人格被作為祭品，武藤遊戲質問道。
“你等會就知道了，桀桀……”馬利克沒有回答武藤遊戲的話，而是讓他自己去領悟。
隨著決鬥的進行，武藤遊戲終於明白了馬利克那話的意思。因為，每當他生命值減少時，表武藤遊戲的靈魂就會殘缺一部分。也就是說，如果他的生命值歸零，那麼表武藤遊戲就會喪命於此。
對於馬利克的這種行為，暗武藤遊戲感到了前所未有的憤怒，他對馬利克將表武藤遊戲作為祭品的行為痛恨不已。
每次看到表馬利克的靈魂減少一些，他的內心便如同刀割。
最終經過一番奮戰，武藤遊戲終於將馬利克打入下風，但如果擊敗暗馬利克，那麼表馬利克也會為此喪命。這讓原本就對守墓一族有些內疚的武藤遊戲，難以下手。
“怎麼了，沒辦法下手嗎！！”看穿了武藤遊戲的內心，馬利克嘲諷道。
“遊戲，不必再猶豫……，我已經有死亡的覺悟！”一個虛弱的聲音從看台下傳來，這聲音雖然來自高崎杏子，但武藤遊戲早知道這並不是她本人在說話。
此時的陳之內克也有些摸不著頭腦，他搖了搖真崎杏子道“杏子，你這麼了？你在說什麼鬼話？”
“請將我和我產生的邪惡之心一起粉碎！”沒有理會城之內克也，高崎杏子繼續說道。
“遊戲，我曾經立下誓言向你複仇，可我現在才發現殺死父親的，是我體內的另一個我！”
此時，大家也發現了此時的真崎杏子應該是被馬利克借用了身體。伊西絲感覺跑了過來，關心的問道“馬利克，你還好吧！”
“這就是法老王最後的試練！”說完後，真崎杏子便倒在了地上。操縱她身體的表馬利克，因為魂力不足而消失。
“馬利克……”望著倒在地上的馬利克，此時武藤遊戲的內心有些複雜。
然而，馬利克沒想到的是，他的這番話，反而讓武藤遊戲更加難以下手了。在真崎杏子倒下之後，武藤遊戲內心之中已經放棄了要將暗馬利克擊敗的想法，而是在思索著如何保全他。
原本的優勢，也在一次一次的抵抗中消耗殆儘，最多還有一次攻擊，武藤遊戲就會生命值歸零。
終於，轉機出現了。
一個搖搖晃晃的身影出現在了場上，並一點點的逼近暗馬利克。
“你這家夥還活著啊，利希德，真是難纏的家夥！”看見來人是誰，暗馬利克的表情開始變得猙獰起來。
一點一點艱難的靠近，卻被暗馬利克使用千年錫杖擊退，但利希德並未放棄。被擊退後，又再次靠近，又被擊退又靠近。
再一次靠近，當暗馬利克又準備揮舞千年錫杖將利希德擊退之時，他臉上的表情開始變得掙紮起來。原本被徹底壓製的表馬利克的靈魂，開始劇烈的反抗起來。
捂著自己的頭，馬利克艱難的叫到“快攻擊我，遊戲！”
“馬利克！”知道說這話的是表馬利克，武藤遊戲下定決心發動了攻擊。
當攻擊奏效之後，歐貝裡斯克的巨神兵被徹底擊潰。而原本作為祭品的表馬利克靈魂，此時已經被更改為了暗馬利克。
任由暗馬利克如何蠱惑，但表馬利克不為所動，最終選擇了投降。而暗馬利克，也因為他自己製定的規則被徹底消滅，武藤遊戲與馬利克的決鬥終於迎來了結局。
接下來琪莎拉與海馬瀨人的戰鬥，琪莎拉以絕對的優勢擊敗了海馬瀨人。
最終的決賽，是琪莎拉與武藤遊戲的對決。
在決鬥開始之前，李繼默經過一陣測試，確認琪莎拉也能使用神之卡之後，便把自己珍藏了許久的太陽神拉的翼神龍交給了她。
至此，打開法老王記憶之門的三張神之卡成功集結了。