告彆凱撒先生後，小智一行人朝著下一個目標紅蓮道館進發。
一路上一行人經曆了暴風雨的單車路，幫助了百變怪克服變身難題，路過了皮卡丘聚居的森林後，也見到對伊布情有獨鐘的四兄弟.......
經過漫長的旅程，小智等人來到了一個名為黑暗市的小城鎮。
小剛看著空空蕩蕩的街道，“不太對誒，大白天的，為什麼一個人影也沒看見呢？真的好奇怪。”
話音剛落，三人前方不遠處的房子內就衝出一個小孩。
“不要隨便跑到外麵，被神奇寶貝訓練家看到了，怎麼辦呢？”
小孩還沒跑出去幾步，便被家長追出來帶回了屋子內。
“欸，什麼意思啊？神奇寶貝訓練家怎麼他們了嘛？”小霞有些生氣道。
咻～
“皮卡丘鐵尾。”
聽到有東西襲來，小智急忙叫皮卡丘進行格擋。
將飛來的石子打飛後，小智對著屋頂說道：“上麵的那幾個小孩，我看到你們了，快點下來。”
屋頂上，三個小男孩聽到小智的話後，手腳一亂，直接掉了下來。
“喂，你們幾個沒事吧？”小智連忙上前查看情況。
“你們幾個是神奇寶貝訓練家嗎？”
一個紅衣服的小男孩問道。
“是啊。你們仇視神奇寶貝訓練家，是不是有人利用神奇寶貝做壞事？”小智詢問道。
“這還是我來跟各位說吧，這些孩子給你們添麻煩了。”
這時一個大叔跑了過來。
“幾位，你們先到我家來一下，我們坐下來慢慢說。”
在這位大叔的帶領下，小智他們來到了一家餐館。
“不瞞你們說，事情是這樣的，我們市裡的亞斯道館和卡茲道館，為了爭奪聯盟下發的神奇寶貝道館資格，正在聘請旅行的訓練家當打手，結果一有事，他們就不分場合搞起神奇寶貝決鬥，大家就是因為經常受到波及，才會對神奇寶貝訓練家產生厭惡的。”大叔解釋道。
“這樣嗎？看來這兩個道館的問題還真不是一般的大。”
“這樣吧，我們幫你們解決這件事好了。”小智提議道。
道館這玩意賺錢是很輕鬆的，小智估計，這兩個道館都想著成為黑暗市的門麵道館，然後斂財。
這種為了一己之私，就讓神奇寶貝做壞事，實在難以原諒。
“來了！”
一個小孩看著窗外喊道。
“怎麼啦？”小霞疑惑地看著屋外的情況。
“是亞斯道館和卡茲道館的小鬥爭。”大叔看著屋外，臉上的神情變得緊張起來，“幾位，你們還是先到二樓去吧。”