也許真的是朱翊鈞發菩提心，嘗試解決溺嬰問題獲得了福報。萬曆七年年底，莊靜嘉梅開二度，終於為皇帝生了嫡長子，因怕夭折，暫時未起名——但給了一個洛郡王的封號。
皇長子兼嫡子的誕生竟然沒有直接封親王，也給宗室改革的相關方做了榜樣。至於皇帝繼承的問題，朱翊鈞評估了本時空自己的身體，認為暫時不著急。而且，這個問題要在帝國實施政體改革的時候一並解決。朱翊鈞判斷，將來少不了一番龍爭虎鬥。
洛郡王的誕生，朱翊鈞沒有大赦天下，僅接了眾臣和各藩國的賀表、禮物，並頒下賞賜予以祝賀。並下詔對於日後赦免的條件進行了規定
除兩宮太後和皇帝身體有恙，需要大赦予以祈福之外，其餘冊封皇後、誕生皇子，設立太子等情況，朝廷將不再大赦天下。
按照皇帝給兩宮的承諾，在皇後確認懷孕後，朱翊鈞開始讓後宮嬪妃雨露均沾。因為醫學院已經研究明白女子懷孕與生理期之間的關係，後宮尚儀局對皇帝所禦嬪妃做了相應的安排，結果出乎意料的好。
不到三個月，宜妃被診斷出喜脈。隨後捷報頻傳，王昭妃、張端嬪、李敬嬪、陳淑嬪先後懷孕，讓兩宮太後以為活在夢中。
朱翊鈞一改孝宗以後皇室子嗣艱難的頹勢，天下臣民大多歡欣鼓舞。尤其勳貴眾臣見皇帝如此能乾，無不喜動顏色——賀表雪片似來。
曆朝曆代，皇帝的家的子嗣都不僅僅是私人問題，而是關係到天下能否穩定，太平能否持續的頭等大事。因此，一個具有很強生育能力的皇帝是很值得表揚和鼓勵的，而朱翊鈞一口氣讓這麼多妃嬪懷上龍種，簡直是皇中表率，帝中精英。
萬曆八年初，經過兩年多的試點，並總結經驗教訓，完善方案。總理內閣大臣張居正請旨，朱翊鈞允準，在全國推開一條鞭法。
在變法之初，張居正就指出，一條鞭法的順利推行取決於清丈土地和重新編戶的成果。
萬曆六年開始的全國清丈和編戶，在朱翊鈞的大力支持下，以嚴刑峻法為約束，終於在萬曆七年年底全麵完成。
本次清丈和編戶，共在全國清出新增土地九百萬頃，是原時空清丈成果的三倍；全國人口統計數最終落在一億六千九百萬，比原時空多出近一半。
能取得如此大的成果，其實與朱翊鈞掌權後幾年來有意識的消除相關阻力分不開。
對於清丈所麵臨的政治壓力，朱翊鈞並未像原時空的萬曆那般，讓張居正抱著“破家沉族”、“力竭而死”的破釜沉舟的決心和毅力來與天下為敵。
在對全國進行了階級分析和政治勢力詳細調研的基礎上，朱翊鈞幾年來先是在江南打擊士族，以“鬆江奴變”為引子，對過度占有土地和隱瞞戶口的士族進行了嚴厲打擊。
以徐階為代表的江南縉紳，被皇帝一連串的手段打的暈頭轉向，而且報紙的興起，更是剝奪了縉紳在士林清流中的話語權，讓他們的抵抗完全沒有掀起浪花。
而皇帝和張文明的先後遇刺，更是給朱翊鈞強力清理、壓製縉紳以正當性和口實。經曆了白色恐怖的南北縉紳，對於朝廷清丈的詔旨，完全失去了抵抗的意誌，接受程度完全出乎張居正的預料。
而對於勳貴占地和隱瞞戶口，朱翊鈞則采取了贖買的辦法。鹽場拍賣，以土地換積分的政策，將勳貴的土地收割大半。隨後，朱翊鈞放風勳貴，讓其中大地主將注意力放到海貿上，以英國公為代表的勳貴又吐出了大量的土地。
對於最難啃的宗室，朱翊鈞利用宗室改革，大棒加胡蘿卜一起上，土地問題解決的也相對較好。
這三方，就是原時空對清丈和一條鞭法抵觸最強烈的三股政治勢力。被朱翊鈞一番操作後，清丈工作開展的非常順滑——就算其中有一些雜音和抵抗，也是局部問題，並未引起全局的波動。對於這些小問題，張居正手段齊出，給安排的明明白白。
在朱翊鈞看來，開啟了殖民地模式的大明，人地矛盾將來會得到極大緩解。至於現在為什麼不更進一步跨到“鄉紳一體納糧”，主要是出於以下考慮。
一方麵，經過測算，在全麵清丈和編戶之後，朝廷全麵加強了士人免稅額度的管理力度，“鄉紳一體納糧”所增加的賦稅寥寥無幾，與朝廷所付出的政治代價完全不成正比。
其次，“鄉紳一體納糧”主要是在朝廷管理效能低下的情況下，用一刀切的方式收稅。這與朱翊鈞將來用免稅手段調節社會管理的目的相悖。而且更重要的是，本時空的一條鞭法其實已經比原時空進步——士人的免稅是以退稅的形式實現的，也就是他們先交了賦稅，然後朝廷按照其免稅額度予以返還。