大業九年八月，煬帝駕幸高陽。
楊廣聞說楊玄感叛軍已被撲滅，終於放下心事，因使大理卿鄭善果、禦史大夫裴蘊、刑部侍郎骨儀與留守樊子蓋四人，推鞫楊玄感餘黨。
四人領旨稱諾，隋帝複對裴蘊囑道：楊玄感一呼而從者十萬，朕益知天下人不欲其多，多即相聚為盜耳。若不儘加誅戮，無以懲後，卿須識之。
因此裴蘊仰承帝意，皆以峻法治之。此事之後，煬帝見中原皆反，便啟駕往幸江都。
隋帝在江都坐猶未穩，黃門入報：今有山東章丘杜伏威、臨濟輔公袥率眾起事，轉向淮南，會合苗海潮、趙破陳等部，自稱將軍，聲勢大盛，進逼江都。
煬帝聞而大怒，便於江都調派兵馬，使葉萬緒為將，命限期撲滅各地叛軍。
葉萬緒奉旨，率兵進攻劉元進、朱燮、管崇等部，逼其退保黃山，然後圍剿。劉元進、朱燮逃跑，管崇被擒。葉萬緒斬殺管崇，及其將卒五千餘人，收其部眾子女三萬餘口。
煬帝複派江都丞王世充，發淮南兵數萬人進討劉元進。
王世充渡江進剿，頻戰皆捷，劉元進、朱燮敗死於吳郡，餘眾或降或散。王世充召降者焚香為誓，約不殺降，哄騙義軍餘眾歸降之後，全部坑於黃亭澗，死者三萬餘人。
因此劉元進餘黨複又相聚為亂，官軍遂不能討，以至隋亡。
大業十年，春二月，辛未。隋煬帝不顧天下盜賊蜂起，再詔百僚，議伐高麗。由是廷議數日，群臣無敢言者。戊子日，下詔複征天下之兵，百道俱進。
九日之後，扶風賊帥唐弼便又起兵，自稱唐王，擁立李弘芝為天子，擁眾十萬。
三月，壬子，煬帝行幸涿郡，士卒在道亡者相繼。癸亥日到至臨渝宮，郊祭黃帝，斬叛逃軍士釁鼓，然而逃亡者更眾，不能遏止。
夏四月，榆林太守董純與彭城賊帥張大虎戰於昌慮，大破賊師，斬首萬餘。
五月，庚申日，延安賊帥劉迦論自稱皇王，建號大世，擁眾十萬。因與稽胡裡應外合，侵掠地方。煬帝時至北平，詔命左驍衛大將軍屈突通為關內討捕大使，發兵進擊劉迦論。
兩軍戰於上郡，屈突通斬獲劉迦論，及其部眾首級萬餘，俘獲男女數萬人返師。
當時天下已亂，隋朝所征之兵大多失期不至，然而高麗亦因兩次大戰，以至困弊不堪。來護兒引軍前至畢奢城，高麗舉兵迎戰，被來護兒一戰而擊破。隋軍將直趨平壤，高麗王元大懼，遣使乞降，囚送主戰大臣斛斯政至朝。
隋煬帝聞而大悅，遂遣使持節，召來護兒還兵。
來護兒聞旨，大集眾將言道：我軍三出，未能平賊，此時若還，不可複來。勞而無功，吾竊恥之。今高麗實困，若以此眾擊之，不日可滅其國。我欲進兵徑圍平壤，生擒高元，獻捷而歸，不亦善乎！
眾將皆都哄然稱是。來護兒於是答表請行，不肯奉班師詔命。
長史崔君肅固爭不可，來護兒言道：賊勢破矣，獨以相任，自足辦之。我今在閫外，事當專決，寧得高元還而獲譴。舍此成功，所不能矣！
崔君肅複告眾將：陛下脾性，何人不知！若從元帥違拒詔書，某必當聞奏，諸公則非但無功，皆應獲斬罪也。
諸將聞言而懼，俱至中軍，請元帥還兵。來護兒無奈，仰天長歎，隻得奉詔班師。
八月己巳，隋煬帝自懷遠鎮班師。有邯鄲賊帥楊公卿聞知，率其黨徒八千人抄襲車駕後衛第八隊，得飛黃上廄良馬四十二匹而去。
冬十月丁卯，天子駕至東都；十二日後，還至西京。
於是告祭太廟，命斬高麗使者及斛斯政，以為犧牲；並將斛斯政肉煮熟，饗以百官，有奸佞媚上之徒，竟食至飽。分肉之後，將斛斯政挫骨揚灰。
祭罷太廟，煬帝複下詔旨，征召高麗王元入朝，高元竟抗旨不至。煬帝此時方悟來護兒之奏，不由大悔，複敕命將帥嚴裝，更圖後舉，隻因天下大亂，竟不果行。
高元雖然抗旨不朝，但隋帝以為高麗既服，亦算大勝。乃命於西京南郊舉行祭祀，但煬帝未曾齋戒。於是正行祭禮之時，天上刮起大風，百官不能張目。
數日之後，告變奏疏至京：離石郡胡人劉苗王造反，自稱天子，眾至數萬；又有汲郡賊帥王德仁擁眾數萬，據守林慮山為盜。
煬帝聞報大怒，將欲親自巡視東都洛陽，以便調動天下諸郡軍馬討賊。太史令庾質以天相有變苦諫，皇帝大怒，詔命將其下獄縊死。於是駕至東都，宣布大赦天下。
時有東海賊帥彭孝才，引眾轉掠沂水，被彭城留守董純擒之。董純雖然屢戰屢捷，而境內盜賊日滋，朝中便有佞臣獻譖，說其怯懦縱敵。
煬帝大怒，命枷鎖董純至於東都，誅殺於市。
孟讓自長白山起兵搶掠各郡，至盱眙時擁眾十餘萬人，占據都梁宮，以淮水為屏障。
江都郡丞王世充率兵往剿，連下五道柵欄，阻塞險要，以示己弱。
孟讓笑道：王世充文法小吏，怎能帶兵？諸公看我生擒之，大張旗鼓進入江都！
然而王世充雖然外示以弱，但當時百姓皆都築壘自衛，堅壁清野，孟讓部眾漸漸陷入饑困，再無戰力。於是孟讓就留少量兵力圍住五柵，分兵大半，往四處搶掠。
王世充趁此揮軍出擊，大破孟讓，斬首萬餘。孟讓僅以身免，帶十數騎逃出重圍。
複說齊郡賊帥左孝友，亦擁眾十萬，屯於蹲狗山據守。郡丞張須陀列營圍山逼之，聲言將放火燒山，左孝友至於窘迫，隻得出降。
張須陀由此威振東夏，以功遷升齊郡通守，兼領河南道十二郡黜陟討捕大使。
時有涿郡賊帥盧明月，擁眾十餘萬軍據守祝阿，帝命張須陀往剿，張須陀僅以萬人前往邀戰。兩軍相持十餘日，隋兵糧儘，軍心將亂。
張須陀下令退軍，乃謂眾將士道：賊將若見我退，必悉其眾來追。此時若以千人襲據其營，可獲大利。但敵有十萬之眾，以千人往襲，亦是大危之事，爾等眾將，誰能往者？
眾將聞言莫對，皆都股栗。忽聞階下同時大叫，閃出兩員猛將，張須陀閃目看時，正是愛將羅士信，以及曆城秦瓊，同時出班，請令而行。
張須陀讚道：壯哉，二位果是蓋世英雄！