地下研究所內發生的前部分經過與張定珊口述的大致相同，不同之處在於，李啟明腦海中存有地下四層和五層的相關信息。地下四層和地下五層隻能通過研究所中間的暗門進去，或者利用連接地麵的便捷通道進入。李啟明在地下四層用活人圈養實驗體，有時還讓小愛前往四層展示異能。小愛的異能乃是從母親那裡繼承而來的隔空撕裂，在無意識的情況下撕裂活人時，由於威力過於強大，常常會把活人的靈魂也撕裂出體外，使其成為四處飄蕩的遊魂。
帶有怨氣的遊魂是能夠傷害他人的，跟隨李啟明的特戰隊員往往會被遊魂侵入身體，變成癡傻的軀殼，而後也被李啟明推進變異體群中充當養料。
地下四層的變異人不斷增多，遊魂的數量也與日俱增，李啟明為緩解地下空間壓力，曾打開地麵鐵蓋放出許多，結果卻是，憑借研究所的力量根本無法阻止變異人到處搗亂。那時放出變異人完成體之後，李啟明後悔得腸子都青了，變異人和遊魂四處傷人，搞得他連研究都無法進行，隻能躲進地道避難。他派出一些隊員出去打探情況，卻都有去無回。大量的村民也因畏懼研究所的恐怖，紛紛搬離到外圍生活。
混亂的局麵持續了很長一段時間，張定珊用母愛引導天真的小愛，召喚傀儡子蟲變異人回歸到了地下研究所內，不去驚擾外麵的普通居民。
經過一番教訓，李啟明讓人加固了研究所的出入鐵門，窗戶換成防彈玻璃，地下四層和五層的暗門和外部鐵蓋也沒有輕易打開過。
隨著小愛漸漸長大，識了字、明了理、看過外界的花草樹木，逐漸能夠分辨是非善惡。她渴望與自己的父母以及子蟲載體前往外界生活，擺脫那個如同地下黑洞般的研究所。
李啟明的警覺意識超乎常人，察覺到李忠平一家三口經常探討的異常舉動後，提前備好銷毀研究所的汽油，並下達了一係列銷毀重要資料的命令。
八五年六月，晚八點，李啟明和小愛一家人發生了正麵衝突。先是李忠平被李啟明殺害，緊接著張定珊和小愛帶領女魅、變異人、大量血屍、乾屍裡應外合，迅速控製了研究所及其周圍片區。李啟明借助山洞暗道逃出村外請求支援，可那時薑家大姐的處境極為艱難，一方麵被關押審查中，另一方麵還要醫治病變，根本無暇顧及yr2研究所的混亂局麵，讓他自己解決問題。
李啟明孤注一擲，給自己注射了各種能量液。說來也巧，眾多普通人都未能在實驗中成功，而李啟明的身體一次性就承受住了能量液的細胞改造，從而擁有了一各種異能。李啟明運用心靈控製，令張家正常異能者以及外麵的特戰隊、警備隊與張定珊和小愛展開了殊死搏鬥。
整整一個晚上，雙方傷亡慘重，研究所周圍的房屋建築毀壞不堪。
張春陽心係普通人的性命，不願讓這場毫無意義的爭鬥波及外界，帶領自己的親信族人，引爆了早些時間在外圍邊界安置的炸彈，炸出了一條綿延千米的隔離溝壑。張家土係異能者齊心協力又築起了一道紅磚牆，算是為鳳凰村做出的最後一點貢獻。
心靈幼小的小愛，無法掌控體內強大的傀儡蟲力量，在心急暴怒之下釋放了所有傀儡能量。巨大的撕裂氣息席卷而來，當時的爆炸場麵堪比一顆小型導彈。在場的活人、女魅、變異人、血屍、乾屍瞬間被撕裂成塵埃碎片。那些活人被撕裂後，靈魂全部被擊出體外，飄向遠方。
李啟明被小愛的力量嚇得膽戰心驚，炸傷的身體恢複些許知覺後，從地洞一點點爬出了村外。那時年輕的編外人員張春生和薑澤嘯想要過來查看情況，發現了重傷的李啟明，便背著他離開了鳳凰村。
李啟明的腦海中還有一些記憶，比如曾經多次隱身潛回yr2研究所，帶回去的能量液對普通人毫無作用。京城張家和薑家大姐的李家鬨翻之後，不再提供異能子弟參與這種害人的研究，致使李啟明一直在苦苦尋找合適的實驗對象。
還有此次前來，李啟明暗自帶來了五名唯命是從且實驗成功的隱形異能者，就連研究所都毫不知情。張春生在地下三層翻閱到了極為重要的機密文件，上麵記載了yr2研究所研發的變異人竟是用來刺殺當年朝廷的胡、鄧、葉、陳、趙五位元老的。按理來說，張春生是站在研究所這邊的，卻因大罵李啟明是東華罪人，最終被滅口。
讀取了過多的信息，原本就虛弱的我，此刻腦袋愈發疼痛起來。拖著疲憊不堪的身軀，我朝著金子和胖子休息的帳篷走去。
胖子沒有參與後來的任務，因而精神狀態極佳，能吃能睡，好不快活。金子的恢複速度更是驚人，從被打飛打散到如今僅僅一個小時，就已經跟個沒事人一樣，正繪聲繪色地給胖子講述在地下的種種遭遇。
他倆見我走進帳篷，看到我臉色難看，金子連忙勸我彆操心太多，說道：“來這個破村折騰成這樣，差點把命都丟了，你已經做得夠意思了，休息，休息。”
我讓胖子幫我喊張天博和張天威來這裡，我有一些事安排，很重要。胖子二話不說去喊倆堂哥。
我是半睡半醒之間交代了一些事情，張定珊和小愛的解決辦法我已經想好了，等我恢複精神就可以搞定；張海珠和張青雲不要去打攪，她們是研究所的棋子，張家沒必要難為她們；李啟明現在已經不是人了，要趕緊除掉，免得再生事端；後麵一句話聽得金子和胖子直樂，我說的是“你們害我不淺，得加錢……”
張天博知道我出力不少，說道：“加錢不成問題，你好好休息，等等等等。”巴拉巴拉了一堆，我已經沉沉睡去了。
喜歡新說鈕一篇請大家收藏：新說鈕一篇天悅更新速度全網最快。