三月七日，邱處機又向成吉思汗辭行，成吉思汗不好再推脫，隻得同意。
成吉思汗向邱處機一行贈送大批金銀珠寶和很多牛馬，邱處機一概不受，並說，非常感謝成吉思汗的饋贈，但修道之人不好財貨，隻要給我們提供馬匹和足夠的糧食物資，能返回中原就足夠了。
成吉思汗問一邊的劉仲祿，真人在漢人地區有多少弟子？
劉仲祿回答說，長春真人創立全真教龍門派，他的弟子有很多。在德興府的龍陽觀，那裡麵有幾百名道士都是真人的弟子，我在那裡曾看見官府在催征督辦差發，要讓觀裡道士服勞役。
成吉思汗對耶律楚才說，幫我擬一道詔書，凡是長春真人門下弟子，一律不當差不服役，不繳稅不納糧，由當地官府劃撥土地，讓他們自給自足，對生活困難的道士，當地官府還要給予補助，讓他們可以安心修道。
邱處機向成吉思汗深深鞠躬的說，貧道代弟子謝成吉思汗。
三月十日，邱處機一行正式辭彆成吉思汗，在劉仲祿等一百餘名騎兵的保護下，啟程返回中原地區。臨彆之時，成吉思汗和邱處機都飽含淚水。
成吉思汗說，和真人相處數月，感到十分愉悅，但願以後還能相見，並請隨時書信於我。
丘處機也感動的說，雖然相隔萬裡，但貧道心中惦記成吉思汗，也會隨時在天尊麵前為您祈福的。
成吉思汗和邱處機揮淚告彆。
邱處機一行離去後，蒙古大軍主力繼續北上。
四月，蒙古大軍主力來到原花剌子模北部地區首府氈的城。術赤汗國任命的氈的城長官阿裡火者率領全城軍民隆重迎接成吉思汗及蒙古大軍主力的到來。
氈的城早在蒙古大軍西征初期，就被術赤所部人馬征服，經過阿裡火者兩年的精心治理，得到很好的恢複，經濟持續增長，人口增加至三十萬。
成吉思汗考慮到花剌子模南部地區戰事還未完全穩定，花剌子模殘軍和印度軍隊仍然駐守申河南岸，危險尚未完全解除，於是決定在氈的城設立行宮，指揮全局戰事。
成吉思汗命令兀魯兀台的第九萬人隊東進，駐紮於訛答剌城，協助察合台負責原花剌子模東部地區、現察合台汗國轄區的防務；命令納圖爾的第四萬人隊西進，抵達玉龍傑赤，協助術赤負責原花剌子模西部地區、現術赤汗國東部地區的防務。成吉思汗則在博爾術、耶律楚才的協助下，率領博欒台的第三萬人隊、郭寶玉的第六萬人隊、窩闊台的第十萬人隊共計三萬騎兵，以及一萬步兵，駐紮於氈的城。這一萬步兵主要是後勤步兵，是成吉思汗從原金國中部地區、原西方三國、原西遼等地帶來的老兵，都是百戰餘生，對成吉思汗忠心耿耿。成吉思汗對他們也很厚待，給他們每人都配有戰馬，幫助蒙古大軍主力押運糧食物資。
成吉思汗率領蒙古大軍主力駐守氈的城，不僅是協助術赤防衛術赤汗國東部地區，而是以此為據點，負責整個原花剌子模地區的防務。
在氈的城駐守的日子裡，成吉思汗和原來沒有戰事的時期生活狀態有所不同。每天淩晨卯時初刻，成吉思汗起來以後，吃了麵餅、喝了馬奶，即親自指揮三萬騎兵進行訓練。
成吉思汗聽從邱處機的建議，不再大規模圍獵，即使士兵們想通過狩獵改善夥食，他也不再參與。
成吉思汗的訓練方式，主要是到氈的城周圍的城池進行拉練，近則一二百裡，遠三四百裡，有叛亂則鎮壓叛亂，無叛亂則展示兵威。
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