光煦二年，正月初三日寅卯時分，三郡官兵從四麵八方向四腳牛發起進攻。經過三天激戰，苗侗軍民抵擋不住，打了敗仗，自行散去了。“安黎王”姚文彬率部退入粵西郡懷遠縣（今三江縣）境，終因寡不敵眾，兵敗被俘。
龔繼昌進駐各個村寨，逐戶逐人登記造冊，要保甲長檢舉參加造反人員。保長怕掉腦袋，很快就供出了造反人員名單，官府就在參與起事認的名字下麵劃一條紅杠。
侗民作亂的材料都收到了，龔繼昌召開了民眾大會，逐戶逐人點名，讓劃紅杠的人站在一起，沒有紅杠的人站在一邊。點名完了，官兵就把有紅杠的人包圍捆綁扣留。
“龔軍門，這些人怎麼處置啊？”蘇元春問道。
“元春老弟，我們是過來幫助平叛的，這個燙手山芋不管了吧，讓巡撫大人與趙提督他們自己去處置好了。”龔繼昌應道。
蘇元春很是認同龔繼昌的做法“我們兩個在貴茅郡殺的人可不少了，再參與這次屠殺，我們會折壽的。”
“不過還是得提醒貴茅郡巡撫，不得濫殺無辜。”龔繼昌說。
“這四腳牛的反賊已經在貴茅郡反對朝廷二十餘年了，不殺也不行啊。”蘇元春說道，“放了他們，還會繼續造反的。”
“反正是不想再殺人了……”龔繼昌說完，帶著部下回到了鎮遠府。
二月七日，六甲、六約、龍額、地坪、滾董的起事者被押送到高岩打鐵坳，首先被斬首的是“安黎王”姚文彬，所有的人都被處斬。
南江、水口兩腳的人押送到古邦五裡外的關公廟宇內，暗中在廟內的四角按放四大桶，深夜子時點火，炸死了一千多名參與起事的苗侗民。
貴茅郡境內的團練武裝在鎮壓“四腳牛”侗族義軍後，在四腳牛一帶村寨大肆洗劫，耕牛、什物一擄儘空，許多侗寨被付諸一炬。
龔繼昌一部沒有參與此次打劫，對此行為深惡痛絕，在與雲貴總督岑毓英談論治理苗疆策略之時，提到了四腳牛慘案一事，岑毓英聽聞之後，甚為震驚立馬上書小皇帝光煦帝，彈劾貴茅郡巡扶與提督，強烈請求嚴懲二人。
岑毓英，清和國晚大臣，粵西郡西林今廣西西北部與雲貴邊界人。字顏卿，號匡國，秀才出身，有武藝。岑毓英異母弟岑毓寶曾代理雲貴總督，其子岑春煊擔任過兩廣總督，那勞岑氏“一門三總督”，是近代中國最顯赫的家庭之一。
同慶皇帝接到奏折後，甚覺事態嚴重，令洋務大臣李章桐火速進京，因為貴茅郡的巡撫與提督都是李章桐一手推介的。
李章桐是淮軍首領，此人奸詐多端，對內主張血腥鎮壓，對外卻妥協退讓，與荊南軍關係甚為緊張。他得知雲貴總督彈劾自己的手下，是因龔繼昌“多管閒事”而起，遂向拉拉氏皇太後建議，以大賞平定苗疆有功之臣為名，讓龔繼昌與蘇元春二人進京麵聖，實則是要當麵對質。
遠在辰州駐防的龔繼昌不知道這是李章桐設下的一個圈套，接到聖旨之後，欣喜若狂，他帶著隨從十餘人，一路北上，到了京都。
一到皇宮，太後拉拉氏一小皇帝的名義在朝堂廷上大宴群臣。文臣武將的桌子上都擺滿了佳肴美酒，可龔繼昌與蘇元春的桌上隻有酒，沒有菜。大家都在興高采烈地喝酒吃肉、說說笑笑的。
龔繼昌很是納悶，正想發作，內務太監擊掌三下，兩個禦膳房的夥計端著菜上來了，托盤上是有三個特色菜牛癟、竹筍、蕨菜。
“龔軍門、蘇軍門，這是太後娘娘賞賜給你們二位的，請你們慢慢享用。”禦膳房的夥計笑眯眯地說，將菜放在了龔繼昌與蘇元春的桌上。
龔繼昌一看這幾道菜就想作嘔，尤其是那牛癟，從牛肚子裡麵擠出來的草料，根本就沒法吃的，遂問“還有彆的膳食沒有？”
“龔軍門，這是老佛爺恩典給您的。”那夥計說完，就退了下去。
“繼昌兄，開吃吧，玉蘭片、龍爪，上好的禦菜。”蘇元春拿起筷子就吃將起來，還吃得津津有味的。
龔繼昌一看彆人的桌上都是燕窩、魚翅、鹿肉、鮑魚等名貴菜肴，而自己和蘇元春的隻有三道民間家常菜，心裡很是不滿，拿著筷子吃了一口乾竹筍，自覺難以下咽，噗地一下吐了出來，不由大怒，猛地一拍桌子，大罵“娘的，我龔某為國出生入死，流血掉肉的，卻給我等吃這樣的菜，這不是有意羞辱我等嗎！？”
隨即，龔繼昌將桌子掀翻在地，內盤散落一地，站了起來，往殿上走去，欲和拉拉氏太後說理。蘇元春想攔住他，都來不及了。